蚌埠醫學院是國家第一批卓越醫生教育培養計劃試點高校、國家級大學生創新創業訓練計劃首批試點高校、安徽省高校綜合改革首批試點單位，是暨南大學、陸軍軍醫大學博士研究生聯合培養單位和安徽省博士后崗位設置單位。學校創建于1958年7月，由原上海第二醫學院分遷和安徽醫學院援建而成，1968年改稱蚌埠反修醫學院，1970年9月，與安徽醫學院合并，改名為安徽醫學院蚌埠分院，1974年6月，恢復稱蚌埠醫學院。